Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms