Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC13P31276 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC13P31276 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms