Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA1P29973 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA1P29973 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms