Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MARCKSP29966 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms