Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRR2P28476 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRR2P28476 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms