Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRB3P28472 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms