Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTR2AP28223 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HTR2AP28223 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms