Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGB2P26583 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGB2P26583 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGB2P26583 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms