Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE1P24864 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNE1P24864 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms