Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPREP23469 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPREP23469 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPREP23469 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPREP23469 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPREP23469 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPREP23469 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPREP23469 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPREP23469 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPREP23469 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPREP23469 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPREP23469 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPREP23469 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms