Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA6P23229 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGA6P23229 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms