Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMNB1P20700 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNB1P20700 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms