Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP4AP20648 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP4AP20648 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms