Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM21P19474 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM21P19474 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms