Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2EP19388 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR2EP19388 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms