Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6P18850 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6P18850 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF6P18850 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF6P18850 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF6P18850 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF6P18850 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6P18850 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6P18850 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6P18850 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6P18850 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATF6P18850 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATF6P18850 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF6P18850 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF6P18850 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATF6P18850 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6P18850 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6P18850 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6P18850 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6P18850 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATF6P18850 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF6P18850 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF6P18850 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms