Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RCC1P18754 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RCC1P18754 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RCC1P18754 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RCC1P18754 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RCC1P18754 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RCC1P18754 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RCC1P18754 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RCC1P18754 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RCC1P18754 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RCC1P18754 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RCC1P18754 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RCC1P18754 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RCC1P18754 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RCC1P18754 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RCC1P18754 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms