Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL17P18621 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL17P18621 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL17P18621 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL17P18621 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL17P18621 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL17P18621 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL17P18621 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL17P18621 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL17P18621 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL17P18621 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL17P18621 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL17P18621 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL17P18621 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL17P18621 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms