Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GAP43P17677 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GAP43P17677 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GAP43P17677 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GAP43P17677 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GAP43P17677 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GAP43P17677 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GAP43P17677 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GAP43P17677 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GAP43P17677 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms