Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA2P17301 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA2P17301 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms