Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA1P15976 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA1P15976 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATA1P15976 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA1P15976 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms