Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSPP15924 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSPP15924 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSPP15924 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSPP15924 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DSPP15924 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSPP15924 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSPP15924 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSPP15924 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSPP15924 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSPP15924 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSPP15924 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSPP15924 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSPP15924 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSPP15924 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSPP15924 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSPP15924 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSPP15924 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSPP15924 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DSPP15924 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms