Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF3P15923 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF3P15923 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF3P15923 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF3P15923 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF3P15923 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF3P15923 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF3P15923 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF3P15923 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF3P15923 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF3P15923 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCF3P15923 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms