Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB3P14651 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms