Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CFTRP13569 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CFTRP13569 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CFTRP13569 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CFTRP13569 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CFTRP13569 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CFTRP13569 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CFTRP13569 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CFTRP13569 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFTRP13569 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFTRP13569 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFTRP13569 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFTRP13569 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFTRP13569 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFTRP13569 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFTRP13569 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFTRP13569 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFTRP13569 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CFTRP13569 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CFTRP13569 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CFTRP13569 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFTRP13569 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFTRP13569 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFTRP13569 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFTRP13569 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFTRP13569 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFTRP13569 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFTRP13569 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFTRP13569 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFTRP13569 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFTRP13569 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFTRP13569 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFTRP13569 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFTRP13569 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CFTRP13569 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CFTRP13569 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CFTRP13569 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFTRP13569 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CFTRP13569 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFTRP13569 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFTRP13569 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFTRP13569 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFTRP13569 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFTRP13569 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFTRP13569 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFTRP13569 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFTRP13569 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFTRP13569 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFTRP13569 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CFTRP13569 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFTRP13569 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFTRP13569 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
CFTRP13569 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFTRP13569 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFTRP13569 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CFTRP13569 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFTRP13569 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CFTRP13569 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms