Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCL5P13501 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL5P13501 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL5P13501 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL5P13501 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL5P13501 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL5P13501 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL5P13501 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCL5P13501 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCL5P13501 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCL5P13501 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCL5P13501 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL5P13501 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL5P13501 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL5P13501 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL5P13501 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCL5P13501 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL5P13501 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL5P13501 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL5P13501 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL5P13501 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL5P13501 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL5P13501 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms