Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB1P11230 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB1P11230 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB1P11230 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms