Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP3P10745 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP3P10745 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP3P10745 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP3P10745 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP3P10745 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP3P10745 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP3P10745 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP3P10745 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP3P10745 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP3P10745 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP3P10745 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP3P10745 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP3P10745 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP3P10745 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms