Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHGAP10645 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHGAP10645 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CHGAP10645 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHGAP10645 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHGAP10645 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHGAP10645 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHGAP10645 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHGAP10645 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHGAP10645 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHGAP10645 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHGAP10645 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHGAP10645 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHGAP10645 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHGAP10645 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHGAP10645 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHGAP10645 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHGAP10645 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CHGAP10645 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CHGAP10645 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHGAP10645 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CHGAP10645 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHGAP10645 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CHGAP10645 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHGAP10645 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHGAP10645 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHGAP10645 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHGAP10645 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHGAP10645 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHGAP10645 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHGAP10645 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHGAP10645 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHGAP10645 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHGAP10645 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHGAP10645 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHGAP10645 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHGAP10645 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CHGAP10645 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHGAP10645 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHGAP10645 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CHGAP10645 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHGAP10645 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHGAP10645 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHGAP10645 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHGAP10645 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHGAP10645 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHGAP10645 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CHGAP10645 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHGAP10645 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHGAP10645 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHGAP10645 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHGAP10645 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHGAP10645 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHGAP10645 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHGAP10645 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHGAP10645 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHGAP10645 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHGAP10645 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHGAP10645 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHGAP10645 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHGAP10645 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHGAP10645 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHGAP10645 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHGAP10645 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHGAP10645 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHGAP10645 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHGAP10645 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHGAP10645 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHGAP10645 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CHGAP10645 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms