Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms