Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM228BP0C875 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM228BP0C875 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms