Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC172P0C7W6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC172P0C7W6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms