Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
C4AP0C0L4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C4AP0C0L4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms