Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MMP10P09238 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP10P09238 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP10P09238 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP10P09238 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP10P09238 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP10P09238 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP10P09238 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP10P09238 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP10P09238 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MMP10P09238 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP10P09238 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP10P09238 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP10P09238 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP10P09238 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP10P09238 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP10P09238 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP10P09238 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP10P09238 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP10P09238 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP10P09238 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP10P09238 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP10P09238 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP10P09238 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP10P09238 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP10P09238 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP10P09238 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP10P09238 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP10P09238 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP10P09238 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP10P09238 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP10P09238 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP10P09238 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms