Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKMP08237 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFKMP08237 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFKMP08237 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFKMP08237 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFKMP08237 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFKMP08237 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFKMP08237 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFKMP08237 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFKMP08237 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFKMP08237 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKMP08237 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKMP08237 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms