Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOP08100 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOP08100 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOP08100 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOP08100 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOP08100 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOP08100 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOP08100 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOP08100 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOP08100 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOP08100 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOP08100 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOP08100 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOP08100 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms