Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC2P02655 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC2P02655 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC2P02655 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC2P02655 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC2P02655 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC2P02655 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC2P02655 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms