Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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