Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNAP29O95721 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNAP29O95721 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms