Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF6O94906 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF6O94906 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms