Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN5O94779 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN5O94779 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN5O94779 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms