Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN11O75508 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN11O75508 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms