Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CILPO75339 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CILPO75339 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CILPO75339 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CILPO75339 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CILPO75339 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CILPO75339 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CILPO75339 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CILPO75339 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CILPO75339 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CILPO75339 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CILPO75339 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CILPO75339 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CILPO75339 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CILPO75339 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CILPO75339 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CILPO75339 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CILPO75339 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CILPO75339 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CILPO75339 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CILPO75339 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CILPO75339 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms