Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EIF5BO60841 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF5BO60841 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF5BO60841 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms