Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BNIP3LO60238 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP3LO60238 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms