Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP9O43818 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP9O43818 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP9O43818 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RRP9O43818 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RRP9O43818 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP9O43818 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP9O43818 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP9O43818 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP9O43818 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms