Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRC1O43663 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRC1O43663 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRC1O43663 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRC1O43663 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRC1O43663 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRC1O43663 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRC1O43663 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRC1O43663 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms