Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC3O43617 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3O43617 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3O43617 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms