Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAD6O43541 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD6O43541 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD6O43541 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms