Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA2O43464 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA2O43464 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms